※ 本文為 MindOcean 轉寄自 ptt.cc 更新時間: 2020-02-01 09:58:43
看板 Gossiping
作者 標題 Re: [爆卦] 疑似啦，武漢肺炎病毒的RNA
時間 Sat Feb 1 05:38:55 2020
今天剛好老闆對這有興趣要我們查sequence，
所以拿起已經查的東西來對了一下發現根本對不到HIV的序列，
於是直接拿HIV-1 gp120的序列來找一下該論文裡的序列。
我用的gp120序列accession number: NP_579894.2
結果文章裡的三個insert序列中，
insert 1、insert 2完全不存在於我用的序列data裡，
insert 3有對到但大概是像下面這樣↓
NP_579894.2 104 TDLKNDTNTNSSSG 117
T L N+T NSSSG
論文序列 2 TYLFNETRGNSSSG 15
identities：64%，勉勉強強但又覺得挺不像...
至於gag那個我還沒有去對。
文章裡寫說他使用的HIV-1的序列放在supp. table 1裡，
但是我找不到這個table，請問有人知道他到底用哪個序列對出來的嗎？
P.S.
我沒有任何幫中國護航的意思，
哪天中國真的要做什麼生化武器我是一點都不意外，
我只是覺得要講一句話必須有憑有據，
所以發表出來的文章都需要經得起檢驗。
平常我是很懶的人，只是剛好不小心比對了一下，
發現好像有一點疑問，所以提出來而已。
--
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※ 文章代碼(AID): #1UD9vnyH (Gossiping)
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※ 同主題文章:
02-01 04:16 ■ [爆卦] 疑似啦，武漢肺炎病毒的RNA
02-01 05:02 ■ Re: [爆卦] 疑似啦，武漢肺炎病毒的RNA
● 02-01 05:38 ■ Re: [爆卦] 疑似啦，武漢肺炎病毒的RNA
02-01 06:23 ■ Re: [爆卦] 疑似啦，武漢肺炎病毒的RNA
02-01 06:23 ■ Re: [爆卦] 疑似啦，武漢肺炎病毒的RNA
02-01 07:38 ■ Re: [爆卦] 疑似啦，武漢肺炎病毒的RNA
02-03 00:35 ■ Re: [爆卦] 疑似啦，武漢肺炎病毒的RNA
噓 : 推 以免人家知道我看不懂1F 27.242.100.4 台灣 02/01 05:39
噓 : 看不懂2F 123.193.209.236 台灣 02/01 05:40
推 : 這就有點扯了，但怎麼可能都要發表了，還會3F 107.242.121.15 美國 02/01 05:41
→ : 犯這麼低級的錯誤
→ : 犯這麼低級的錯誤
我也不喜歡質疑別人的論文，
只是手上剛好有序列比對了一下卻對不到，
所以才開始有點疑問...
推 : 我也是這麼覺得5F 202.190.23.95 馬來西亞 02/01 05:41
推 : 有人想抹黑祖國！6F 8.37.43.201 日本 02/01 05:42
噓 : 難道該table被河蟹了嗎?抖,害怕中...7F 114.136.87.225 台灣 02/01 05:42
噓 : ？？？8F 111.252.65.227 台灣 02/01 05:42
噓 : ...9F 114.136.13.111 台灣 02/01 05:44
→ : 那現在我應該相信誰10F 1.162.128.240 台灣 02/01 05:44
→ : 先高調推 免得我看不懂11F 61.223.58.102 台灣 02/01 05:45
推 : 推，只能靠多一些專業的人去驗證了12F 74.113.164.50 美國 02/01 05:45
推 : 跟我想的一樣13F 180.217.158.114 台灣 02/01 05:47
推 : 學術論文不嚴謹的很多 所以才要審查14F 39.9.172.95 台灣 02/01 05:47
→ : 這篇是還沒過審的吧 有很多問題也正
→ : 常
→ : 這篇是還沒過審的吧 有很多問題也正
→ : 常
→ : 上面某些人反應比病毒專業知識還難理解吧17F 27.242.62.194 台灣 02/01 05:48
推 : 純推，拜託打我臉，我還想去看電影18F 180.217.248.9 台灣 02/01 05:49
→ : 不戴口罩幹= =
→ : 不戴口罩幹= =
推 : bioRixv就是平台給你放非正式投稿20F 143.48.85.134 美國 02/01 05:54
→ : 所以正確度跟嚴謹度跟正式發表的有
→ : 所以正確度跟嚴謹度跟正式發表的有
推 : 推推22F 61.230.0.235 台灣 02/01 05:56
→ : 段距離是正常的23F 143.48.85.134 美國 02/01 05:56
我只覺得，都是發表的東西，你好歹也要有個87%像才講那些話，
這樣就算我沒有對到完全一樣的東西，
我也會覺得可能我查到的序列是經過變異的。
但是insert 1和insert 2現在是連對都對不到，
（這是文章裡宣稱HIV-1 gp120上面的序列）
那就有點奇怪了...
除非有人可以找到他使用的序列accession number，
否則我有點懷疑這篇作者是不是挺故意的...
Daily General Post - Jan. 31, 2020 | Questions, images, videos, comments, unconfirmed reports (Weibo / social media) : China_Flu
![[圖]]()
r/China_Flu: In December, a novel coronavirus strain (2019-nCoV) emerged in the city of Wuhan, China. This subreddit seeks to monitor the spread of … ...
![[圖]](https://external-preview.redd.it/XkeAFZWC7RZ-WQFHN7rVa0Ajip6KUhHrsYhjBE8aLg8.jpg?auto=webp&s=277d90d260fd0e28b83e7355bbfc5d7371d1ef13)
噓 : 喔26F 114.136.13.111 台灣 02/01 05:57
推 : 剛查了一下這篇發表在bioRxiv上…27F 101.9.140.221 台灣 02/01 05:57
推 : 笑話居多
推 : 笑話居多
推 : 看來我可以安心去睡了29F 39.9.172.95 台灣 02/01 06:00
推 : 笑話嗎 那我也要去睡啦～30F 123.110.30.166 台灣 02/01 06:01
推 : 怕31F 42.74.153.14 台灣 02/01 06:05
推 : 阿三真夠扯的32F 107.242.121.15 美國 02/01 06:10
推 : 那我也要去睡啦33F 42.73.255.132 台灣 02/01 06:12
推 : 那我也要睡啦34F 223.136.134.48 台灣 02/01 06:13
推 : 謝謝讓我今晚可以安穩睡覺35F 36.226.179.111 台灣 02/01 06:13
→ : 喔不 已經早上了
→ : 喔不 已經早上了
推 : 感謝信心加持 可以睡了37F 39.9.166.181 台灣 02/01 06:14
→ : 幹 天亮了
→ : 幹 天亮了
推 : 阿三搞笑喔 又被吹牛逼給騙了39F 111.252.254.71 台灣 02/01 06:15
推 : 上面噓的是......40F 61.223.14.128 台灣 02/01 06:16
![[圖]](https://i.imgur.com/Qj2ypAa.jpg)
推 : 那我也要睡啦，幹嚇到天亮42F 180.217.248.9 台灣 02/01 06:17
推 : 推科學！43F 101.12.52.244 台灣 02/01 06:17
![[圖]](https://i.imgur.com/jBPHmkV.jpg)
文章裡武漢肺炎病毒2019-nCoV spike protein的序列沒有問題，
我主要的問題是我無法在HIV-1 gp120裡面找到那些序列。
※ 編輯: jonsauwi (123.194.172.116 臺灣), 02/01/2020 06:22:10
推 : 推 科學研究本來就要很謹慎45F 131.151.114.125 美國 02/01 06:22
推 : 上靠北生科發文啊？46F 172.58.139.0 美國 02/01 06:23
推 : 推個47F 180.217.85.25 台灣 02/01 06:25
推 : 路人還是等上升幾層再來關注好了48F 64.124.137.130 美國 02/01 06:29
推 : 跟我想的一樣49F 101.15.201.15 台灣 02/01 06:30
推 : insert2 ALB06757.1 thknnkseif50F 27.52.41.160 台灣 02/01 06:31
謝謝，補充下面supray板友找到的Accession number：
insert 1 : AFU28737.1
insert 2 : ALB06757.1
insert 3 : ACL98861.1
insert 4 : AKR75206.1
姑且不論insert 4，前三個用的都是不同序列啊...
※ 編輯: jonsauwi (123.194.172.116 臺灣), 02/01/2020 06:38:21
推 : 簡單來說就是太短 連folding 能否bind都不51F 95.91.235.119 德國 02/01 06:42
→ : 知道，用標題來吸眼球
→ : 知道，用標題來吸眼球
推 : 推53F 166.177.187.201 美國 02/01 06:45
推 : 推54F 36.238.34.151 台灣 02/01 06:50
推 : 推55F 114.136.97.84 台灣 02/01 06:55
推 : 在這種時刻還敢丟出這種data，是想要被56F 39.11.163.162 台灣 02/01 07:02
→ : 電得飛高高嗎
→ : 電得飛高高嗎
→ : 論文無法重現不是很正常嗎 (?58F 114.33.176.49 台灣 02/01 07:02
推 : 推推 我也是這麼想59F 219.71.105.123 台灣 02/01 07:04
推 : 寄e-mail去問（嗆）一下發文的人阿。如60F 124.218.46.225 台灣 02/01 07:09
→ : 果太垃圾或是有疑問，這不就是學術領
→ : 域嗎？
→ : 果太垃圾或是有疑問，這不就是學術領
→ : 域嗎？
推 : 風向真亂63F 111.252.65.227 台灣 02/01 07:11
推 : 希望不是…64F 49.217.99.23 台灣 02/01 07:14
推 : 推一下，連學術界都有各種風向，先觀望65F 36.230.108.157 台灣 02/01 07:16
推 : 先推66F 107.220.69.28 美國 02/01 07:25
→ Wand …
推 : 全民定序定起來68F 42.74.27.178 台灣 02/01 07:48
推 : 不然反過來問，如果我要做生化武器，69F 180.177.58.11 台灣 02/01 07:48
→ : 肺炎+愛滋病毒是不是好選擇
→ : 肺炎+愛滋病毒是不是好選擇
推 : 真的看不懂qq71F 223.137.182.3 台灣 02/01 07:57
推 : 推查證72F 112.104.85.37 台灣 02/01 07:58
推 : 推定序73F 42.74.4.159 台灣 02/01 07:59
推 : 推推74F 42.76.153.15 台灣 02/01 08:28
推 : 發表的期刊分數很低是嗎？75F 101.13.229.183 台灣 02/01 08:35
推 : 嗯嗯跟我想的一樣76F 101.12.100.73 台灣 02/01 08:41
推 : 嗯 我看不懂77F 111.248.18.10 台灣 02/01 08:41
推 : 噓的人是在想啥?78F 114.136.158.19 台灣 02/01 08:54
推 : 嗯嗯 剛剛我在想早餐吃什麼79F 118.232.223.218 台灣 02/01 08:56
推 : 這件事可以很單純但好像也不單純80F 223.136.28.49 台灣 02/01 09:02
推 : 有查證先推81F 220.136.83.205 台灣 02/01 09:13
推 : 有查的幫推82F 114.136.86.77 台灣 02/01 09:30
推 : 有沒有鄉民版本的翻譯一下嗚嗚 我只知道A83F 223.137.77.210 台灣 02/01 09:34
→ : TCG
→ : TCG
推 : 原來印度仔在唬爛！！！85F 110.50.137.211 台灣 02/01 09:39
推 : 怎麼好像這篇很厲害86F 114.32.210.239 台灣 02/01 09:40
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